26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02470 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  45.22 
 
 		 1271 aa  1086    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02470  vacuolar membrane protein, putative  100 
 
 		 1330 aa  2737    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80838  predicted protein  37.5 
 
 		 1268 aa  865    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217919  normal  0.355381 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  25 
 
 		 808 aa  194  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29594  RND family transporter: Patched (Ptc) segmentation polarity protein  25.49 
 
 		 1183 aa  154  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  24.78 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  24.56 
 
 		 956 aa  74.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45835  predicted protein  23.74 
 
 		 1462 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.720628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2969  CzcA family heavy metal efflux protein  27.59 
 
 		 1054 aa  50.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  27.65 
 
 		 764 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  26.79 
 
 		 1027 aa  48.5  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.39 
 
 		 807 aa  48.5  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  24.7 
 
 		 1066 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  27.72 
 
 		 1017 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2952  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  26.7 
 
 		 1055 aa  46.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.513525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.72 
 
 		 1017 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  30.77 
 
 		 1082 aa  47  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  30.77 
 
 		 1076 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  27.72 
 
 		 1017 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.57 
 
 		 1054 aa  46.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2433  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.62 
 
 		 1051 aa  45.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  28.83 
 
 		 1074 aa  45.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  29.52 
 
 		 1076 aa  45.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  27.17 
 
 		 1017 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  30.36 
 
 		 1038 aa  45.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.21 
 
 		 1059 aa  45.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>