22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80838 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  42.32 
 
 		 1271 aa  981    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02470  vacuolar membrane protein, putative  37.84 
 
 		 1330 aa  882    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80838  predicted protein  100 
 
 		 1268 aa  2613    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217919  normal  0.355381 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  21.39 
 
 		 808 aa  155  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29594  RND family transporter: Patched (Ptc) segmentation polarity protein  21.38 
 
 		 1183 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  24.41 
 
 		 956 aa  90.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  26.24 
 
 		 918 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45835  predicted protein  21.21 
 
 		 1462 aa  62.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.720628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.03 
 
 		 807 aa  56.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00950  conserved hypothetical protein  20 
 
 		 1444 aa  53.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  28.39 
 
 		 805 aa  49.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1025 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1071 aa  47.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327.1  multidrug resistance protein  23.92 
 
 		 629 aa  46.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1040 aa  46.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  24.54 
 
 		 1024 aa  45.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1026 aa  45.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1029 aa  45.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  29.37 
 
 		 1036 aa  45.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  27.23 
 
 		 1012 aa  45.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.95 
 
 		 898 aa  45.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  27.23 
 
 		 1012 aa  45.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>