More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4327.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  71.94 
 
 		 1040 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327.1  multidrug resistance protein  100 
 
 		 629 aa  1269    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  70.3 
 
 		 1028 aa  895    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  87.94 
 
 		 1025 aa  1123    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  71.45 
 
 		 1040 aa  907    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  87.46 
 
 		 1030 aa  1118    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  70.14 
 
 		 1036 aa  919    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  88.1 
 
 		 1027 aa  1129    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  58.71 
 
 		 1038 aa  668    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  71.45 
 
 		 1022 aa  914    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  97.93 
 
 		 1029 aa  1233    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  86.49 
 
 		 1023 aa  1078    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  51.29 
 
 		 1032 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  50.16 
 
 		 1034 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1034 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  50.16 
 
 		 1026 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  49.12 
 
 		 1029 aa  598  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1029 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  50.16 
 
 		 1015 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1031 aa  589  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  48.79 
 
 		 1014 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  50 
 
 		 1015 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  48.63 
 
 		 1014 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  47.96 
 
 		 1019 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  48.79 
 
 		 1014 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  47.8 
 
 		 1019 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  48.63 
 
 		 1014 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  47.91 
 
 		 1009 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  48.87 
 
 		 1035 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  50.16 
 
 		 1026 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 		 1025 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  47.99 
 
 		 1018 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  47.59 
 
 		 1017 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1026 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  47.02 
 
 		 1028 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  47.17 
 
 		 1029 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1027 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  47.5 
 
 		 1018 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  46.78 
 
 		 1030 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1027 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  47.17 
 
 		 1029 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  45.17 
 
 		 1028 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  46.75 
 
 		 1033 aa  545  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  47.28 
 
 		 1040 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  45.87 
 
 		 1012 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  44.61 
 
 		 1036 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.61 
 
 		 1036 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  44.61 
 
 		 1036 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0945  acriflavin resistance protein  42.54 
 
 		 1021 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0774817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.44 
 
 		 1036 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  44.46 
 
 		 1047 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  44.3 
 
 		 1047 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.32 
 
 		 1036 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  43.98 
 
 		 1047 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  44.12 
 
 		 1017 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  44.05 
 
 		 1032 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  44.21 
 
 		 1026 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  45.35 
 
 		 1021 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.89 
 
 		 1043 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  43.64 
 
 		 1017 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  43.49 
 
 		 1033 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  44.39 
 
 		 1037 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  43.32 
 
 		 1013 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.61 
 
 		 1033 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.61 
 
 		 1033 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.61 
 
 		 1033 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  44.61 
 
 		 1033 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  46.01 
 
 		 1058 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  43.59 
 
 		 1029 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  44.27 
 
 		 1026 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  44.16 
 
 		 1029 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  44.46 
 
 		 1024 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  44.28 
 
 		 1025 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1011 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1025 aa  485  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  43.96 
 
 		 1025 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  42.65 
 
 		 1021 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  41.25 
 
 		 1024 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1878  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  44.93 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1553  acriflavin resistance protein  44.93 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000421809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  39.49 
 
 		 1022 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  42.04 
 
 		 1020 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  38.94 
 
 		 1064 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  38.55 
 
 		 1028 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  41.99 
 
 		 1025 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  38.82 
 
 		 1012 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.05 
 
 		 1024 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  38.66 
 
 		 1012 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  38.17 
 
 		 1051 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1030 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 		 1031 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.28 
 
 		 1031 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1031 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1031 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  38.94 
 
 		 1023 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  37.82 
 
 		 1031 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  37.82 
 
 		 1031 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  37.4 
 
 		 1019 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  37.99 
 
 		 1031 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>