15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33000 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_33000  RND family transporter: Dispatched segment polarity protein (cholesterol release)  100 
 
 		 1154 aa  2352    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.69508 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29977  predicted protein  25.42 
 
 		 1011 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0323795  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86304  predicted protein  29.63 
 
 		 716 aa  95.1  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  21.98 
 
 		 1271 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  24 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  25.3 
 
 		 956 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  27.42 
 
 		 898 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  23.49 
 
 		 918 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.95 
 
 		 872 aa  49.3  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  25.15 
 
 		 694 aa  48.5  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.08 
 
 		 1359 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3339  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  21.99 
 
 		 1530 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  20.81 
 
 		 805 aa  47.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  23.29 
 
 		 879 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.43 
 
 		 694 aa  45.8  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>