More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0572 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0522  acriflavin resistance protein  49.86 
 
 		 1032 aa  1043    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.302221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1132  acriflavin resistance protein  60.56 
 
 		 1034 aa  1313    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0572  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1033 aa  2092    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000015454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1051 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1028 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1029 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1043 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1034 aa  363  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1055 aa  360  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1043 aa  359  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1011 aa  357  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1050 aa  356  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1031 aa  352  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1023 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1036 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1032 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1038 aa  347  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 1496 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1044 aa  336  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1058 aa  335  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1042 aa  334  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1039 aa  333  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1071 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.22 
 
 		 1068 aa  329  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1041 aa  328  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1058 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1060 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1095 aa  326  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1058 aa  326  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1043 aa  326  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1059 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1039 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1088 aa  324  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1470 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1035 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1050 aa  323  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1044 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1040 aa  322  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1024 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1040 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.68 
 
 		 1069 aa  319  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1040 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1037 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  26.66 
 
 		 1405 aa  318  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1033 aa  318  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.16 
 
 		 1036 aa  318  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1046 aa  318  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1033 aa  318  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1036 aa  317  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1063 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1044 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1028 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.03 
 
 		 1024 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1028 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1028 aa  314  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.34 
 
 		 1050 aa  314  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1053 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1058 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1022 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1006 aa  312  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1049 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1028 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1041 aa  311  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1075 aa  311  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1009 aa  310  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1031 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1034 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1088 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1037 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  25.35 
 
 		 1088 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1065 aa  307  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1016 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1032 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.69 
 
 		 1040 aa  305  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1031 aa  305  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 		 1070 aa  304  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1053 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1031 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  27.44 
 
 		 1013 aa  302  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1041 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1027 aa  301  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1044 aa  301  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1101 aa  300  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1026 aa  300  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1044 aa  300  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1066 aa  300  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1055 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.23 
 
 		 1081 aa  300  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1044 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1083 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1042 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1044 aa  298  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1048 aa  296  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.23 
 
 		 1034 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1055 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  24.23 
 
 		 1034 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>