More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1422 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  77.43 
 
 		 860 aa  1332    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  46.59 
 
 		 881 aa  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  100 
 
 		 865 aa  1742    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  41.44 
 
 		 877 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.87 
 
 		 905 aa  178  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.44 
 
 		 898 aa  176  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.82 
 
 		 816 aa  165  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.89 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25 
 
 		 1083 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.79 
 
 		 815 aa  134  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.08 
 
 		 1051 aa  133  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22.85 
 
 		 872 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.67 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.95 
 
 		 835 aa  129  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.37 
 
 		 815 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.11 
 
 		 821 aa  126  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  27.84 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  24.66 
 
 		 808 aa  124  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.59 
 
 		 813 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.95 
 
 		 837 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.24 
 
 		 756 aa  117  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  19.93 
 
 		 823 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.32 
 
 		 824 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.59 
 
 		 807 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.66 
 
 		 831 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.96 
 
 		 779 aa  114  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  22.49 
 
 		 825 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  27.12 
 
 		 778 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  24.95 
 
 		 800 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.8 
 
 		 806 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  22.29 
 
 		 1204 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.32 
 
 		 821 aa  105  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  23.44 
 
 		 1131 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.86 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  27.14 
 
 		 869 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  27.14 
 
 		 869 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  26.14 
 
 		 751 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  24.05 
 
 		 808 aa  95.1  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.07 
 
 		 823 aa  95.1  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  19.89 
 
 		 823 aa  94.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.47 
 
 		 773 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.77 
 
 		 807 aa  91.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.29 
 
 		 767 aa  91.3  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.27 
 
 		 792 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.55 
 
 		 764 aa  88.6  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.32 
 
 		 967 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  28.68 
 
 		 811 aa  85.1  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.73 
 
 		 790 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 763 aa  83.2  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.56 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.7 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.21 
 
 		 796 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  20.76 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  22.31 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.57 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  23.01 
 
 		 689 aa  77.4  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.92 
 
 		 791 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.35 
 
 		 727 aa  75.1  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.01 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.34 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  20.79 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.38 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  23.46 
 
 		 765 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  23.22 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  20.54 
 
 		 387 aa  72  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  27.5 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  20.13 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  23.48 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  21.69 
 
 		 805 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.26 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  21.69 
 
 		 805 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  24.46 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.95 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.55 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  20.98 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  28.39 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  23.19 
 
 		 768 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.16 
 
 		 771 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  25.32 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  20.41 
 
 		 801 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  22.52 
 
 		 771 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.04 
 
 		 883 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  28.14 
 
 		 692 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  25.17 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.7 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.43 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  22.43 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.04 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  19.67 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  22.43 
 
 		 771 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  20.74 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.83 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  20.74 
 
 		 805 aa  64.3  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  24.32 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  26.15 
 
 		 1225 aa  64.3  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  23.3 
 
 		 767 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.23 
 
 		 895 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  28.4 
 
 		 862 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  25 
 
 		 786 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  25 
 
 		 786 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>