More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2400 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  75.14 
 
 		 189 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 192 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  68.11 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  67.57 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  65.1 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  64.17 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  58.51 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  54.26 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  47.37 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.44 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  43.86 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  43.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>