More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1950 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 222 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  38.38 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 196 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  27.55 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.44 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 677 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  32.56 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  30.39 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.29 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  42.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  30.68 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>