More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0316 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 341 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  27.91 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  29.94 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  25.56 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  26.81 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  24.49 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  26.58 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  25.47 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.04 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  24.12 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  24.32 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  26.51 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  25.63 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  25.63 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  25.63 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  26.9 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  23.56 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  26.28 
 
 		 357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  26.93 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  27.47 
 
 		 634 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  25.62 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  25.72 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.9 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.4 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  24 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  24.69 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.47 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  24.42 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  24.16 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  25.99 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  24.52 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  28.16 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  23.96 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  26.75 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  25.46 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  31.83 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  23.46 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  23.55 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  24.57 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  26.75 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  27.36 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  25.21 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  30.38 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  27.24 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  24.23 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.42 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  24.23 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  25.7 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.13 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  25.91 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  34.87 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  25.77 
 
 		 1155 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  26.06 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.56 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  30.58 
 
 		 307 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  28.04 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.14 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.06 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  25.46 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  30.15 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  31.2 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  26.27 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  28.04 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  26.06 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  31.19 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0764  polyprenyl synthetase  32.73 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30.67 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.19 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  26.07 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.18 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  26.84 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28.95 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  25.97 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  26.79 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  24.86 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  23.64 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  24.47 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  24.47 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.08 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  24.47 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  26.44 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  28.73 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  23.15 
 
 		 365 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  32.27 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  24.43 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  27.68 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.9 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.75 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>