More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0628 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  41.26 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  34.65 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.19 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.53 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  28.37 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.62 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>