86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2976 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  50.66 
 
 		 1140 aa  1089    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 1145 aa  2320    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  47.82 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2273  hypothetical protein  34.02 
 
 		 482 aa  244  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  30.65 
 
 		 241 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  31.6 
 
 		 247 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 		 455 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25.95 
 
 		 440 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  28.64 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  32.08 
 
 		 238 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.11 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.25 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  31.55 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.71 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  32.08 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1094 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.61 
 
 		 1343 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 		 451 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25 
 
 		 1148 aa  71.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 		 261 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  34.45 
 
 		 322 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 		 1505 aa  70.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 		 242 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3508  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.94 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0541197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  28.74 
 
 		 272 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 		 231 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.43 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 321 aa  64.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  29.31 
 
 		 1194 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  31.85 
 
 		 226 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 		 1438 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 240 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 		 217 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 		 1444 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  27.59 
 
 		 198 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  26.52 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.93 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  25.4 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  24.69 
 
 		 209 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  23.08 
 
 		 247 aa  55.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 		 212 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1224 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  25.75 
 
 		 260 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 		 268 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 255 aa  53.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 		 290 aa  53.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 		 313 aa  53.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 		 198 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 		 211 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.41 
 
 		 666 aa  52.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.23 
 
 		 510 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.04 
 
 		 670 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  20.26 
 
 		 254 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.88 
 
 		 216 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 		 629 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  29.14 
 
 		 447 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  23.99 
 
 		 958 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  24.84 
 
 		 263 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.31 
 
 		 304 aa  48.5  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 		 229 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  48.5  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  48.5  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 		 218 aa  48.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  23.79 
 
 		 254 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  26.54 
 
 		 240 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  25.4 
 
 		 259 aa  46.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.37 
 
 		 215 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  33.8 
 
 		 838 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.76 
 
 		 959 aa  45.8  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  23.14 
 
 		 558 aa  46.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  30.23 
 
 		 259 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.33 
 
 		 1328 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.11 
 
 		 193 aa  45.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.01 
 
 		 490 aa  45.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  31.07 
 
 		 244 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.44 
 
 		 320 aa  45.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.32 
 
 		 642 aa  45.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.15 
 
 		 1041 aa  44.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>