102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1700 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1700  PKD domain containing protein  100 
 
 		 724 aa  1509    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0653279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  37.11 
 
 		 1367 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 2554 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 1732 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 3295 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.26 
 
 		 1606 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.14 
 
 		 792 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  36.25 
 
 		 971 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  24.67 
 
 		 873 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  34.88 
 
 		 967 aa  52  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  36.25 
 
 		 971 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.18 
 
 		 713 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  29.2 
 
 		 971 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  36.25 
 
 		 971 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.36 
 
 		 679 aa  50.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  35.71 
 
 		 1042 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  44.68 
 
 		 838 aa  50.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.82 
 
 		 685 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.9 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  31.96 
 
 		 960 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  35.82 
 
 		 658 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.82 
 
 		 675 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.82 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  32.35 
 
 		 965 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.98 
 
 		 1667 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  35 
 
 		 971 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  35 
 
 		 971 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1667 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  35 
 
 		 971 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  47.5 
 
 		 439 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  35 
 
 		 971 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 819 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1387 aa  49.3  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  31.37 
 
 		 184 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.82 
 
 		 848 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  33.33 
 
 		 965 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  35 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  30.09 
 
 		 1241 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  33.33 
 
 		 965 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.55 
 
 		 1862 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.73 
 
 		 1842 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 777 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46 
 
 		 823 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 528 aa  47.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  30.86 
 
 		 317 aa  47.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  31.96 
 
 		 960 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  31.25 
 
 		 965 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.53 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1282 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.37 
 
 		 2122 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  32.47 
 
 		 791 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.89 
 
 		 978 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  28.32 
 
 		 575 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  31.96 
 
 		 960 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.71 
 
 		 1292 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  44.12 
 
 		 3197 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  35 
 
 		 971 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  31.52 
 
 		 965 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  33.71 
 
 		 787 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  43.4 
 
 		 1380 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 		 1200 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 1057 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.78 
 
 		 953 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  32.47 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  34.21 
 
 		 644 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.24 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  31.18 
 
 		 965 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  31.25 
 
 		 965 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44.64 
 
 		 930 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  46 
 
 		 786 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  51.35 
 
 		 1356 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.29 
 
 		 869 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  44.12 
 
 		 3197 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.2 
 
 		 1300 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.37 
 
 		 547 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  45.65 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.36 
 
 		 1528 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  55.88 
 
 		 1096 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.25 
 
 		 965 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  36.49 
 
 		 561 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.36 
 
 		 941 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.18 
 
 		 719 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  32.86 
 
 		 734 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  51.28 
 
 		 1389 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.73 
 
 		 945 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.82 
 
 		 1094 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.2 
 
 		 1969 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  35.53 
 
 		 752 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  54.55 
 
 		 929 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  48.65 
 
 		 400 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  31.33 
 
 		 587 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.68 
 
 		 958 aa  44.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  50 
 
 		 1230 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  42.11 
 
 		 1095 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  27.08 
 
 		 500 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.81 
 
 		 1120 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1682 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.09 
 
 		 963 aa  44.3  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  38.6 
 
 		 551 aa  43.9  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>