More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1289 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  71.2 
 
 		 191 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  70.37 
 
 		 191 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 191 aa  260  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  49.73 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  24.71 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  22.38 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  42.31 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 246 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  24.26 
 
 		 253 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 437 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>