More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2110 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  100 
 
 
480 aa  978    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  76.61 
 
 
481 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  66.52 
 
 
478 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  65.88 
 
 
476 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  64.96 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  57.97 
 
 
504 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  53.04 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  51.02 
 
 
479 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  51.63 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  51.83 
 
 
486 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  48.13 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  47.74 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  50.96 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  42.66 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  42.66 
 
 
442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  43.17 
 
 
444 aa  300  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  37.9 
 
 
727 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  37.43 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  41.44 
 
 
1134 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  38.93 
 
 
1631 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  36.82 
 
 
785 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  32.52 
 
 
513 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  35.2 
 
 
531 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  35.2 
 
 
531 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.22 
 
 
614 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  42.67 
 
 
820 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  30.85 
 
 
648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.33 
 
 
1133 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.78 
 
 
745 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.05 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.84 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.64 
 
 
1112 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  38.14 
 
 
713 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  28.78 
 
 
606 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  37.71 
 
 
713 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.89 
 
 
1112 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  31.67 
 
 
641 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  35.59 
 
 
486 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.47 
 
 
928 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  43.51 
 
 
1037 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.75 
 
 
768 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.19 
 
 
1180 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.78 
 
 
2701 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.01 
 
 
2133 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 
2198 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  44.27 
 
 
677 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 
515 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 
759 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  44.23 
 
 
4285 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.88 
 
 
5218 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.61 
 
 
1269 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  37.32 
 
 
2467 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.61 
 
 
1269 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  30.58 
 
 
1202 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.28 
 
 
686 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 
1016 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  31.42 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.8 
 
 
2678 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  46.67 
 
 
6753 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  45.45 
 
 
856 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  49.4 
 
 
2524 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.21 
 
 
5962 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  43.33 
 
 
8682 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  45.45 
 
 
768 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.74 
 
 
1403 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  26.72 
 
 
861 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  34.59 
 
 
2743 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  47.67 
 
 
1883 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  41.38 
 
 
901 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  32.14 
 
 
362 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  43.33 
 
 
9030 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.6 
 
 
1394 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.05 
 
 
1019 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.96 
 
 
553 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  60 
 
 
2885 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.44 
 
 
709 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.84 
 
 
561 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  32.35 
 
 
656 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  34.15 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  55.71 
 
 
556 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  36.42 
 
 
2251 aa  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  50.65 
 
 
221 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
2704 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 
5839 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  33.6 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  51.76 
 
 
589 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  36.8 
 
 
917 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  42.17 
 
 
889 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.58 
 
 
2542 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.83 
 
 
4836 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 
2097 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  37.01 
 
 
2452 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.34 
 
 
998 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.05 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  46.24 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  50.67 
 
 
1502 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  44.16 
 
 
4848 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 
2239 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>