More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2362 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.77 
 
 		 1054 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.98 
 
 		 1060 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.34 
 
 		 1060 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.72 
 
 		 1041 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.75 
 
 		 1067 aa  786    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  39.24 
 
 		 1063 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1063 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  46.01 
 
 		 1034 aa  876    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  46.53 
 
 		 1052 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  38.33 
 
 		 1049 aa  730    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  37.58 
 
 		 1055 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  39.58 
 
 		 1075 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  54.55 
 
 		 1038 aa  1053    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1063 aa  769    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  39.44 
 
 		 1039 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  42.3 
 
 		 1042 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1032 aa  2068    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  48.99 
 
 		 1121 aa  966    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1060 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  35.57 
 
 		 1057 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 		 1063 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 		 1067 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  37.98 
 
 		 1053 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  39.38 
 
 		 1044 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 		 1073 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  39.46 
 
 		 1067 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1050 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  41.16 
 
 		 1051 aa  753    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1063 aa  770    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1067 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 		 1048 aa  775    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.47 
 
 		 1067 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35 
 
 		 1074 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 		 1069 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1061 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.82 
 
 		 1093 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1060 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 		 1053 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1053 aa  591  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  34.66 
 
 		 1048 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1072 aa  583  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  33.08 
 
 		 1050 aa  582  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1062 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1052 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1074 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  33.01 
 
 		 1056 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1033 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1068 aa  562  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1048 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1054 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1050 aa  556  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1041 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  32 
 
 		 1033 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  33.53 
 
 		 1071 aa  548  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.55 
 
 		 1034 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1041 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1041 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1098 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1033 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1043 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1053 aa  536  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1040 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1035 aa  526  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1036 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1030 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1064 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1063 aa  515  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1054 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1035 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.99 
 
 		 1053 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1035 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1030 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1137 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1044 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.53 
 
 		 1135 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1050 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1044 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1043 aa  352  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1028 aa  350  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1058 aa  348  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1092 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1046 aa  343  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1028 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1095 aa  337  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1043 aa  336  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1038 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.04 
 
 		 1191 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1064 aa  335  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1146 aa  334  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1055 aa  333  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1025 aa  332  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1022 aa  331  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1041 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1056 aa  325  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1070 aa  324  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1038 aa  323  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1025 aa  323  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1143 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>