More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3688 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  100 
 
 
1081 aa  2060    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 
1167 aa  331  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1170 aa  289  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 
1164 aa  288  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 
1170 aa  282  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  46.95 
 
 
1194 aa  258  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 
1191 aa  257  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  41.69 
 
 
1174 aa  254  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  50.99 
 
 
1179 aa  253  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  45.34 
 
 
1194 aa  251  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  49.43 
 
 
1199 aa  249  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1187 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  48.19 
 
 
1198 aa  248  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  45.67 
 
 
1195 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  45.67 
 
 
1195 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  45.67 
 
 
1195 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  47.81 
 
 
1184 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  54.25 
 
 
1198 aa  244  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  51.24 
 
 
1194 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  54.17 
 
 
1186 aa  241  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  46.58 
 
 
1188 aa  240  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  49.26 
 
 
1218 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  47.01 
 
 
1181 aa  238  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  48.67 
 
 
1234 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  50.94 
 
 
1190 aa  237  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  52.83 
 
 
1203 aa  234  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  35.21 
 
 
1189 aa  234  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  52.36 
 
 
1227 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  46.74 
 
 
1225 aa  233  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 
1190 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  53.17 
 
 
1214 aa  232  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  49.79 
 
 
1188 aa  232  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.18 
 
 
1184 aa  231  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 
1188 aa  231  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 
1188 aa  231  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  49.34 
 
 
1195 aa  231  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  46.62 
 
 
1191 aa  230  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  37.43 
 
 
1189 aa  229  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  46.18 
 
 
1222 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  37.13 
 
 
1189 aa  229  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  51.89 
 
 
1186 aa  229  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  37.43 
 
 
1189 aa  228  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  51.89 
 
 
1224 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  50.94 
 
 
1263 aa  228  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  47.51 
 
 
1189 aa  227  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  37.68 
 
 
1174 aa  227  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  48.58 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  48.11 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  48.11 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  48.11 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  48.11 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  48.11 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  48.58 
 
 
1189 aa  227  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 
1185 aa  227  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  50.72 
 
 
1185 aa  227  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  35.64 
 
 
1177 aa  226  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 
1175 aa  226  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  49.05 
 
 
1191 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.08 
 
 
1167 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.65 
 
 
1187 aa  223  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 
1167 aa  222  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  39 
 
 
1301 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  52.2 
 
 
1213 aa  222  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.07 
 
 
1179 aa  220  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  53.19 
 
 
1172 aa  220  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 
1176 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  47.6 
 
 
1186 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  48.58 
 
 
1185 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 
1198 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  45.8 
 
 
1162 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  49.53 
 
 
1191 aa  217  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  46.61 
 
 
1185 aa  217  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  48.11 
 
 
1185 aa  217  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 
1176 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  46.36 
 
 
1196 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  43.33 
 
 
1180 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  46.58 
 
 
1190 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1162 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1162 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  46.58 
 
 
1162 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1162 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  45.09 
 
 
1168 aa  211  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  50.98 
 
 
1172 aa  211  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  46.58 
 
 
1162 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  47.95 
 
 
1162 aa  211  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  45.87 
 
 
1187 aa  211  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 
1177 aa  211  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  47.03 
 
 
1162 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  45.38 
 
 
1162 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.91 
 
 
1178 aa  210  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  46.79 
 
 
1162 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  34.22 
 
 
980 aa  208  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  46.92 
 
 
1163 aa  207  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  40.96 
 
 
1176 aa  207  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1177 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  45.12 
 
 
1191 aa  205  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 
1164 aa  204  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  45.37 
 
 
1175 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 
1176 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.15 
 
 
1198 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>