111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2724 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 409 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  66.84 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  34.75 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  52.71 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  52.71 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  34.14 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  51.06 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.72 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.72 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  35.47 
 
 		 427 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  26.24 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.94 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  41.43 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  32.02 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  33 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  33.5 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  26.6 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25.85 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  34.86 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  30.87 
 
 		 409 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  31.03 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  30.16 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  24.73 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  33.02 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  27.56 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  24.77 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  27.66 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  31.37 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  30.32 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  28.42 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  27.83 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  29.27 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  30.1 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  35.71 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.36 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  22.05 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  25.97 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  23.33 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.92 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.34 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  30.99 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  29.56 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 834 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  27.52 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.9 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  22.51 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  28.86 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  22.51 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  26.34 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.17 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  26.29 
 
 		 1343 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  27.12 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  22.94 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.79 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.77 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.44 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  24.76 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.33 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  27.59 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.08 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.07 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.62 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  30.37 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  26.18 
 
 		 183 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  24.84 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.93 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  38.67 
 
 		 549 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.4 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.78 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  24.3 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  38.89 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  30.24 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6670  hypothetical protein  53.85 
 
 		 109 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.994203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.71 
 
 		 477 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  31.68 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  26.01 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.49 
 
 		 620 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  24.21 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.83 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.72 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  24.75 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.5 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  24.48 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  24.6 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  31.08 
 
 		 458 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  25.68 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  21.51 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  33.33 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.77 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.94 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>