76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2273 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 418 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  65.95 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  64.71 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  63.36 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  48.34 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  50.8 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  64.98 
 
 		 450 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  50.44 
 
 		 448 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  63.54 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  64.52 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  64.26 
 
 		 401 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  63.54 
 
 		 453 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  63.54 
 
 		 453 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  50.23 
 
 		 407 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  61.68 
 
 		 420 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  62.09 
 
 		 449 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  61.73 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  64.18 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  63.18 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  63.09 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  61.73 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  63.18 
 
 		 452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  63.18 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  59.57 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  63.18 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  63.93 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  63.18 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  47.39 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  58.36 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  57.72 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  59.19 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  60.59 
 
 		 451 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  57.72 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  56.62 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  56.99 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  55.56 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  60.84 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  61.6 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  56.72 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  55.88 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  55.51 
 
 		 461 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  54.41 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  54.78 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  56.62 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  56.25 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  54.41 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  60.98 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  56.99 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  54.04 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  55.88 
 
 		 460 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  55.88 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  56.88 
 
 		 449 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.64 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.36 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.26 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  30.11 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.09 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.1 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  28.68 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.45 
 
 		 647 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  29.32 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.73 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  28.51 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.4 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  23.51 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  27.27 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.73 
 
 		 577 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.27 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.27 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  28.79 
 
 		 527 aa  50.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  46.43 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  27.98 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  21.61 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  25.11 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  50 
 
 		 70 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>