9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1175 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0882  hypothetical protein  65.09 
 
 		 521 aa  645    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1073    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  32.43 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  24.14 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  20.76 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  28.95 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.59 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  23.85 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  32.39 
 
 		 418 aa  43.5  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>