8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0882 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1058    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  65.28 
 
 		 527 aa  682    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  24.56 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  21.43 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  22.12 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  22.12 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  22.38 
 
 		 483 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  20.52 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>