More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1285 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  68.85 
 
 		 592 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  62.14 
 
 		 520 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  64.18 
 
 		 520 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 522 aa  1017    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.33 
 
 		 519 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.11 
 
 		 523 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.54 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.39 
 
 		 522 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  61.15 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.54 
 
 		 522 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.96 
 
 		 520 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.75 
 
 		 548 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  49.64 
 
 		 562 aa  505  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  47.62 
 
 		 568 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  45.54 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  46.24 
 
 		 545 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  47.69 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  46.69 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.56 
 
 		 522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  47.41 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  46.1 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  47.31 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.52 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  40.49 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  36.78 
 
 		 523 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.33 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.6 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.44 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  32.23 
 
 		 551 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  32.29 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  34 
 
 		 551 aa  226  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  30.6 
 
 		 551 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  30.83 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  30.83 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  30.83 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  32.52 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  30.83 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  30.83 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  30.63 
 
 		 571 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.87 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  31.66 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  32.79 
 
 		 562 aa  209  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.31 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.53 
 
 		 557 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.55 
 
 		 613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.57 
 
 		 532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  29.08 
 
 		 529 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  36.44 
 
 		 765 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.71 
 
 		 596 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.2 
 
 		 474 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  29.23 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.71 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  29.09 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  31.26 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.17 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.46 
 
 		 593 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.12 
 
 		 567 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.16 
 
 		 562 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.04 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.82 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  27.19 
 
 		 566 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.78 
 
 		 550 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.41 
 
 		 560 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.4 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  30 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25.67 
 
 		 575 aa  133  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  28.98 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.52 
 
 		 581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  28.92 
 
 		 505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.28 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25.57 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.75 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.59 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.8 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.08 
 
 		 883 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.9 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.08 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  27.57 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  24.43 
 
 		 570 aa  107  7e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  28.05 
 
 		 577 aa  106  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  24.81 
 
 		 586 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.58 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  28.03 
 
 		 584 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 599 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.76 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.37 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.59 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.98 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.37 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.89 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.31 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  26.57 
 
 		 581 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>