More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1275 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 194 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 194 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.36 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 194 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.9 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 383 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 287 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.17 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.49 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  31.68 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>