More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4420 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 762 aa  1565    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  47.49 
 
 		 781 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  43 
 
 		 808 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  43.53 
 
 		 790 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  38.17 
 
 		 792 aa  492  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 792 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 791 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 738 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 738 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 765 aa  224  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 766 aa  217  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 753 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 768 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.8 
 
 		 768 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 814 aa  170  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 772 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 777 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 780 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.94 
 
 		 760 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.55 
 
 		 760 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 746 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 768 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 747 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 729 aa  118  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 796 aa  101  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 782 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 786 aa  91.3  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 835 aa  87.8  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 781 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.27 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 778 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 809 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  21.3 
 
 		 740 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 809 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.42 
 
 		 809 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 720 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 777 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 701 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  25.93 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 841 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.5 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.5 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.05 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 782 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 796 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  21.81 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 796 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  25.08 
 
 		 693 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  26.46 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.03 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  22.56 
 
 		 740 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 794 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.29 
 
 		 723 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 710 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.72 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 710 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 756 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.72 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.72 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>