More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2384 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1060 aa  2155    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1121 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.2 
 
 		 1052 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 		 1038 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  36.34 
 
 		 1042 aa  695    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  37.37 
 
 		 1034 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  37.98 
 
 		 1032 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1051 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.91 
 
 		 1041 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.14 
 
 		 1067 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1063 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1063 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1063 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1063 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1067 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1067 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1067 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1048 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1050 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.66 
 
 		 1039 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1049 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.37 
 
 		 1067 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 		 1055 aa  556  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  33.24 
 
 		 1044 aa  542  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 		 1093 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1053 aa  532  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1060 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1057 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.18 
 
 		 1075 aa  512  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1073 aa  512  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1060 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1052 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.71 
 
 		 1054 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1074 aa  502  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1069 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  30.5 
 
 		 1050 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1061 aa  499  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1060 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.63 
 
 		 1056 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1041 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1053 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1068 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1098 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1041 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1041 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1062 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1063 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1035 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1033 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1066 aa  439  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1050 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1072 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  30.2 
 
 		 1071 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1053 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1074 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.4 
 
 		 1034 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1033 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1054 aa  416  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1040 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1030 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1054 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  27.56 
 
 		 1048 aa  399  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1048 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1064 aa  376  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.6 
 
 		 1053 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1053 aa  360  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1035 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1131 aa  326  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 		 1050 aa  313  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1035 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1030 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1046 aa  300  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.07 
 
 		 1135 aa  287  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1043 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  22.87 
 
 		 1191 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1056 aa  282  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  24.83 
 
 		 1005 aa  278  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.12 
 
 		 1038 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 		 1011 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  23.51 
 
 		 1044 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  23.87 
 
 		 1017 aa  273  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  23.3 
 
 		 1043 aa  273  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  22.18 
 
 		 1055 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  23.75 
 
 		 1051 aa  271  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  22.43 
 
 		 1034 aa  270  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1092 aa  270  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  24.22 
 
 		 1124 aa  267  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1034 aa  265  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  22.68 
 
 		 1058 aa  264  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  23.47 
 
 		 1134 aa  264  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1039 aa  261  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  23.55 
 
 		 1040 aa  260  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  23.09 
 
 		 1028 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  23.73 
 
 		 1043 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1041 aa  258  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  23.94 
 
 		 1042 aa  257  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>