131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0804 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  100 
 
 		 651 aa  1321    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.72 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.27 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.05 
 
 		 563 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  29.23 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  25.07 
 
 		 509 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.75 
 
 		 616 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  24.8 
 
 		 581 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  26.67 
 
 		 687 aa  97.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  24.67 
 
 		 550 aa  96.3  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  24.78 
 
 		 388 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.28 
 
 		 529 aa  94.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.57 
 
 		 535 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  27.06 
 
 		 646 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 593 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.67 
 
 		 498 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  25.09 
 
 		 441 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.57 
 
 		 540 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27.72 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  22.48 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  23.17 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 568 aa  83.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  23.3 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  25.48 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  25.8 
 
 		 651 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  22.52 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  23 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  26.09 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 		 649 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25.55 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.99 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  29.89 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  26.79 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.2 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.2 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  23.69 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.48 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.58 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  22.9 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 538 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.81 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  31.1 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  24.58 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23.69 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  26.9 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  26.9 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  22.94 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  27.96 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  24.09 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  24.1 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  25.98 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  22.34 
 
 		 509 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  28.77 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  26.14 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  24.04 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  26.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  32.1 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  25.1 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  24.34 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  29.95 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  27.27 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.03 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  25.59 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  23.2 
 
 		 439 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.55 
 
 		 359 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.62 
 
 		 529 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  22.92 
 
 		 515 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  27.03 
 
 		 358 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  25.61 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  22.5 
 
 		 578 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  21.35 
 
 		 538 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  24.14 
 
 		 456 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 295 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  23.01 
 
 		 424 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  23.64 
 
 		 431 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  23.48 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  22.47 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  22.47 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  22.47 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  22.41 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  26.71 
 
 		 560 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 296 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 		 310 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  23.3 
 
 		 310 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 315 aa  48.1  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 296 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.55 
 
 		 362 aa  47.8  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 		 294 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.17 
 
 		 296 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.48 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.17 
 
 		 296 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>