154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5465 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  100 
 
 		 850 aa  1763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  34.47 
 
 		 846 aa  485  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  31.9 
 
 		 844 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.98 
 
 		 831 aa  340  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  29.13 
 
 		 827 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  28.2 
 
 		 818 aa  327  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.69 
 
 		 825 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.22 
 
 		 815 aa  298  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.46 
 
 		 825 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.64 
 
 		 821 aa  264  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  26.04 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  25.71 
 
 		 819 aa  233  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  25.81 
 
 		 816 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  26.24 
 
 		 819 aa  229  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  25.75 
 
 		 813 aa  229  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  26.45 
 
 		 825 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  25.47 
 
 		 816 aa  226  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  25.18 
 
 		 810 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  25.76 
 
 		 808 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  25.49 
 
 		 816 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 817 aa  224  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  25.54 
 
 		 812 aa  224  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 		 816 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  25.36 
 
 		 811 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 		 816 aa  222  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  27.38 
 
 		 840 aa  220  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 		 823 aa  218  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  24.29 
 
 		 852 aa  218  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  25.62 
 
 		 817 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  24.76 
 
 		 823 aa  217  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  24.29 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  25.38 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  24.29 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.8 
 
 		 800 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.02 
 
 		 840 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.02 
 
 		 840 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.52 
 
 		 819 aa  214  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  24.83 
 
 		 845 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  25.15 
 
 		 800 aa  213  9e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  25.32 
 
 		 819 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  25.12 
 
 		 817 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  27.27 
 
 		 813 aa  211  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.53 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  26.26 
 
 		 812 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  29.21 
 
 		 801 aa  209  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  26 
 
 		 816 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.07 
 
 		 805 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  25.87 
 
 		 812 aa  209  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3710  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.21 
 
 		 823 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  24.76 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  30.43 
 
 		 803 aa  206  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  25.77 
 
 		 820 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  23.34 
 
 		 854 aa  205  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  26.01 
 
 		 812 aa  205  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  28.74 
 
 		 819 aa  204  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  25.33 
 
 		 809 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  24.88 
 
 		 820 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  25.29 
 
 		 813 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  22.71 
 
 		 819 aa  200  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  23.47 
 
 		 815 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  24.88 
 
 		 830 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  23.02 
 
 		 822 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  24.05 
 
 		 817 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.64 
 
 		 814 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  24.97 
 
 		 809 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  25.85 
 
 		 847 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  25.3 
 
 		 812 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  26.49 
 
 		 819 aa  195  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  24.4 
 
 		 820 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  25.21 
 
 		 813 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 		 811 aa  195  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  27.01 
 
 		 816 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  27.01 
 
 		 816 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.48 
 
 		 804 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.42 
 
 		 839 aa  193  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  26.47 
 
 		 813 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  25.68 
 
 		 812 aa  191  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  24.97 
 
 		 818 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  24.73 
 
 		 872 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  25.27 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  24.48 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  23.74 
 
 		 817 aa  189  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5418  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.38 
 
 		 892 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5013  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.38 
 
 		 892 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  26.62 
 
 		 814 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  24.94 
 
 		 829 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  25.24 
 
 		 836 aa  185  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  24.76 
 
 		 812 aa  185  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  24.79 
 
 		 836 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  25.03 
 
 		 877 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  24.47 
 
 		 687 aa  184  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 		 821 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  25.18 
 
 		 812 aa  180  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.61 
 
 		 813 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 808 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.26 
 
 		 803 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.45 
 
 		 843 aa  167  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.42 
 
 		 808 aa  164  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.88 
 
 		 850 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.05 
 
 		 805 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>