More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7252 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 304 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.37 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.07 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.31 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  26.96 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>