More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3371 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  63.69 
 
 		 928 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  47.08 
 
 		 955 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  63.79 
 
 		 928 aa  1150    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  63.53 
 
 		 921 aa  1145    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  69.18 
 
 		 858 aa  1116    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  58.31 
 
 		 927 aa  980    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  60.91 
 
 		 902 aa  1095    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  63.93 
 
 		 926 aa  1144    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  45.55 
 
 		 956 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  63.93 
 
 		 926 aa  1144    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  45.55 
 
 		 956 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 922 aa  1880    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  96.42 
 
 		 922 aa  1759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  63.5 
 
 		 926 aa  1144    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  41.04 
 
 		 908 aa  562  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  53.24 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  38.34 
 
 		 906 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  38.34 
 
 		 906 aa  465  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  34.7 
 
 		 853 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  34.08 
 
 		 851 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1019 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 		 958 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  32 
 
 		 1019 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.88 
 
 		 842 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 		 875 aa  313  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 869 aa  310  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 871 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  29.07 
 
 		 1057 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 1074 aa  286  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  41.22 
 
 		 547 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 		 1063 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 		 1063 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 		 1057 aa  281  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.86 
 
 		 1059 aa  279  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.22 
 
 		 1063 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  29.19 
 
 		 850 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  28.5 
 
 		 895 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 		 895 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 1048 aa  263  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 		 895 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 		 923 aa  262  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.6 
 
 		 853 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 		 895 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 892 aa  255  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 		 853 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  28.86 
 
 		 850 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 862 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 891 aa  251  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  26.79 
 
 		 862 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.53 
 
 		 868 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 850 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 850 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.68 
 
 		 910 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.42 
 
 		 928 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.23 
 
 		 853 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 		 933 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  27.73 
 
 		 979 aa  241  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 968 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.32 
 
 		 918 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.41 
 
 		 957 aa  227  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.2 
 
 		 975 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.39 
 
 		 852 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.83 
 
 		 886 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 		 822 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 1094 aa  224  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  27.95 
 
 		 855 aa  221  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.69 
 
 		 901 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 		 918 aa  218  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.28 
 
 		 885 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.28 
 
 		 920 aa  217  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 		 911 aa  217  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  26.24 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.64 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.62 
 
 		 898 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.05 
 
 		 843 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.33 
 
 		 843 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.77 
 
 		 846 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.47 
 
 		 840 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  27.47 
 
 		 890 aa  199  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 920 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  27.44 
 
 		 1284 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 		 920 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 849 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 1284 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 834 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  25.86 
 
 		 834 aa  191  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 835 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 834 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  25.92 
 
 		 865 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  27.28 
 
 		 927 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.4 
 
 		 838 aa  184  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.78 
 
 		 845 aa  184  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 		 961 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  25.84 
 
 		 1111 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1111 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  25.64 
 
 		 1111 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 		 847 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 935 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  25.96 
 
 		 1111 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>