More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1646 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  932    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  57.21 
 
 		 490 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  57.58 
 
 		 473 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  56.8 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  54.88 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  55.22 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  55.73 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  55.73 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  55.48 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  57.21 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  54.23 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  54.45 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  54.45 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  54.23 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  55.73 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  54.39 
 
 		 473 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  53.07 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  53.73 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  53.03 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  53.29 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  53.06 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  54.7 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  51.86 
 
 		 476 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  51.97 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  51.54 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  50.98 
 
 		 475 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  50.98 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  51.75 
 
 		 475 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  51.54 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  51.32 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  52.52 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  49.57 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  48.47 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  46.04 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  46.42 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.46 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.2 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.66 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.16 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.67 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.84 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.51 
 
 		 508 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.45 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.37 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  27.75 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  31.04 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  32.35 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.32 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.5 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.32 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.32 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  30.02 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.67 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.4 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.99 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.05 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  26.77 
 
 		 544 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.12 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.11 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.96 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  26.77 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  28.12 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.11 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.28 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.42 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.24 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.75 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.99 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.83 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.6 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.39 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.08 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  28.61 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  25.52 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.62 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.59 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.71 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  30.83 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.46 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.42 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  28.4 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.96 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.76 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.21 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  29.13 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.57 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.21 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  28.67 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.69 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.18 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.11 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.97 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  29.48 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  26.4 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  30.56 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  29.1 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  24.57 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.98 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>