More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  56.54 
 
 		 600 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  59.45 
 
 		 604 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  74.58 
 
 		 594 aa  910    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  74.58 
 
 		 594 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  56.51 
 
 		 595 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  61.95 
 
 		 622 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  58.95 
 
 		 611 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  77.91 
 
 		 594 aa  929    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  78.96 
 
 		 594 aa  956    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  55.46 
 
 		 600 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  57.76 
 
 		 595 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  59.79 
 
 		 592 aa  720    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  56.3 
 
 		 594 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  56.06 
 
 		 603 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  55.99 
 
 		 595 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  57.62 
 
 		 598 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  57.09 
 
 		 597 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  79.46 
 
 		 594 aa  966    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  100 
 
 		 594 aa  1204    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  57.62 
 
 		 598 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  80.07 
 
 		 594 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  56.92 
 
 		 595 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  58.38 
 
 		 596 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  65.33 
 
 		 601 aa  779    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  59.72 
 
 		 613 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  61.22 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  58.61 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  57.8 
 
 		 615 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  56.87 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  57.73 
 
 		 613 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  55.52 
 
 		 561 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  47.9 
 
 		 605 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  47.98 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  44.46 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 599 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.19 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.36 
 
 		 599 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.02 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 787 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.68 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.9 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.8 
 
 		 580 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.9 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.9 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.58 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.31 
 
 		 557 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.02 
 
 		 568 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 891 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.02 
 
 		 568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  47.19 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  42.2 
 
 		 550 aa  362  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.38 
 
 		 562 aa  362  9e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.26 
 
 		 563 aa  361  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 556 aa  360  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.41 
 
 		 871 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.95 
 
 		 885 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.86 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.36 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  41.21 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  41.21 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.88 
 
 		 571 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 		 523 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 553 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.56 
 
 		 574 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  35.43 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.67 
 
 		 577 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.56 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.07 
 
 		 571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.76 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 565 aa  353  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  40.53 
 
 		 521 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.9 
 
 		 571 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  41.09 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.12 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.77 
 
 		 560 aa  350  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  42.53 
 
 		 523 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 		 515 aa  350  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  48.71 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  36.87 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  36.59 
 
 		 888 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  40.65 
 
 		 521 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  41.06 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  41.63 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>