More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2193 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  67.59 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  54.04 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  51.71 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  45.58 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  44.44 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  44.26 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  49.49 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  50 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  47.17 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  47.46 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  45.56 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.85 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  40.94 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  39.22 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  36.71 
 
 		 178 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.2 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.02 
 
 		 180 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  36.94 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  39.61 
 
 		 179 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  33.54 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  40 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.22 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  37.65 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  32.83 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  38.22 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  38.22 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  34.18 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  37.42 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  39.87 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.38 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.93 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  38.99 
 
 		 179 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  35.95 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.18 
 
 		 178 aa  92  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  34.62 
 
 		 177 aa  92  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  34.83 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  35.26 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  36.46 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  33.33 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  33.73 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  34.97 
 
 		 169 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  36.36 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  35.9 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  34.18 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  34.69 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.71 
 
 		 164 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  35.19 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  38.96 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  37.97 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  39.87 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  39.22 
 
 		 177 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  36.18 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  35.22 
 
 		 172 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  39.87 
 
 		 178 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  38.96 
 
 		 177 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  38.96 
 
 		 177 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  33.76 
 
 		 170 aa  88.6  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  35.37 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  38.56 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  35.44 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  37.66 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.47 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  36.24 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  40.38 
 
 		 176 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  32.65 
 
 		 190 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  35.43 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  30.16 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  35.95 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  32.76 
 
 		 178 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.91 
 
 		 174 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  32.18 
 
 		 178 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.42 
 
 		 165 aa  85.1  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.91 
 
 		 171 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  35.98 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  33.5 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.91 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  39.74 
 
 		 171 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  35.62 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  36.71 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  32.72 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  32.72 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>