125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0883 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0883  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
263 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.326054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0931  TPR repeat protein  94.21 
 
 
274 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0934  TPR repeat protein  93.82 
 
 
274 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0937  TPR repeat-containing protein  65.13 
 
 
279 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376157  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5209  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.290651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
271 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.5 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
681 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
362 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  29.04 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.57 
 
 
865 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.01 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
685 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
750 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.39 
 
 
622 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.81 
 
 
816 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
909 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  36.64 
 
 
545 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
739 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  35.11 
 
 
587 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.07 
 
 
764 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
824 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  35.85 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.71 
 
 
725 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
377 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.74 
 
 
2240 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
583 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
713 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.59 
 
 
795 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
878 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  35.85 
 
 
529 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
502 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 
810 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.88 
 
 
354 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  33.65 
 
 
594 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
235 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
632 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.62 
 
 
875 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.82 
 
 
780 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
762 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 
754 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 
808 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 
754 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  34.51 
 
 
715 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 
688 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.32 
 
 
732 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  39.68 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
1104 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  35.19 
 
 
435 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.35 
 
 
535 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
505 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
2262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
4079 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  36.19 
 
 
864 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 
550 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
3145 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
611 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.43 
 
 
340 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 
1450 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.73 
 
 
779 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
589 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
643 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
635 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
635 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.02 
 
 
1676 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
615 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
596 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
715 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
779 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.19 
 
 
1764 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
789 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
637 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.65 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.66 
 
 
626 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
565 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 
1154 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  28.95 
 
 
437 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
581 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
612 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
542 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 
602 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
636 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
686 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
639 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.52 
 
 
725 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
776 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
1737 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 
887 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  27.19 
 
 
514 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>