More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1340 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 414 aa  815    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  56.45 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  47.74 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  50.16 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  50 
 
 		 358 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  49.38 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  53.56 
 
 		 389 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  51.56 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  53.27 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  53.37 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  43.46 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  54.07 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  49.53 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  42.96 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  50.15 
 
 		 360 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  47.63 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  47.32 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  46.28 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  46.97 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  40.52 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  41.22 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  45.07 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  44.38 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  44.17 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  40.66 
 
 		 423 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  46.48 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  44.65 
 
 		 346 aa  270  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  47.02 
 
 		 432 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  42.56 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  42.56 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  42.56 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  44.16 
 
 		 349 aa  263  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  45.71 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  43.66 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  44.62 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  37.61 
 
 		 989 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.07 
 
 		 977 aa  222  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 		 900 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  42.05 
 
 		 855 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  38.14 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  36.15 
 
 		 303 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.69 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 289 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  33.65 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.16 
 
 		 280 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.6 
 
 		 762 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  34.63 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.65 
 
 		 759 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 		 735 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.55 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.55 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.38 
 
 		 761 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.04 
 
 		 740 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  34.1 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.27 
 
 		 911 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  34.73 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  32.67 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.68 
 
 		 292 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.43 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.01 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  30.35 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.74 
 
 		 307 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 307 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  33.81 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  31.79 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  35 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  32.74 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  31.76 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.55 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 		 763 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 305 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  31.58 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.04 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  32.13 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.23 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.08 
 
 		 309 aa  136  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  31.43 
 
 		 347 aa  136  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  28.72 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.89 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  30.63 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.45 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  31.03 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.13 
 
 		 856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.54 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.15 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.01 
 
 		 991 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  27.72 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31.83 
 
 		 849 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>