More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7695 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 435 aa  878    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.28 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 488 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 454 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.19 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.1 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.21 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  26.84 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  29.38 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.49 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  28.14 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.72 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.26 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  30.71 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 410 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.24 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.48 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.32 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  20.9 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>