More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0017 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  60.27 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  54.11 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  44.08 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  36.15 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  32.86 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  33.49 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  41.24 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  32.07 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  32.18 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  29.11 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  29.73 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.91 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.35 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.66 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>