More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6211 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 413 aa  841    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  31.37 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 390 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  29.81 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  32.67 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.13 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 392 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.71 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.29 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  28.29 
 
 		 416 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  30.46 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.71 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.06 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  27.23 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  29.38 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.51 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.22 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  24.93 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  26.82 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  25.85 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>