More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0667 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  100 
 
 		 423 aa  861    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  41.24 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  27.2 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  25.87 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  25.37 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.35 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  29.05 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  22.84 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  25.66 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  24.37 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  28.62 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  22.64 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  26.47 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  28.23 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  22.44 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.94 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  26.85 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6073  Extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.94 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  24.29 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  24.51 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.11 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.11 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.11 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.11 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.72 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  27.31 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  26.11 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.86 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  27.16 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>