More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2700 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  100 
 
 		 848 aa  1760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  40.93 
 
 		 803 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  36.02 
 
 		 824 aa  502  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.43 
 
 		 862 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  29.22 
 
 		 894 aa  250  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 888 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.36 
 
 		 897 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.64 
 
 		 707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.97 
 
 		 704 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.07 
 
 		 717 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 932 aa  195  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.05 
 
 		 805 aa  194  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.86 
 
 		 750 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 806 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.01 
 
 		 922 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.03 
 
 		 743 aa  188  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.72 
 
 		 1015 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.64 
 
 		 805 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.24 
 
 		 607 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.33 
 
 		 928 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.46 
 
 		 813 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 591 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 832 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.31 
 
 		 686 aa  175  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 		 919 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.9 
 
 		 824 aa  172  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.72 
 
 		 741 aa  171  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 598 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 979 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.77 
 
 		 1171 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 1185 aa  164  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  27.42 
 
 		 763 aa  164  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.49 
 
 		 604 aa  164  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.25 
 
 		 600 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.29 
 
 		 785 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 		 903 aa  161  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 858 aa  162  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  160  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.8 
 
 		 972 aa  159  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 807 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.3 
 
 		 625 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.93 
 
 		 984 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  23.39 
 
 		 587 aa  155  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 781 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.02 
 
 		 781 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 754 aa  151  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.07 
 
 		 858 aa  150  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  25.13 
 
 		 558 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  25.59 
 
 		 604 aa  147  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 1175 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 		 925 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.49 
 
 		 804 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.49 
 
 		 804 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.91 
 
 		 913 aa  143  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  23.19 
 
 		 670 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  24.44 
 
 		 590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  23.71 
 
 		 603 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  23.71 
 
 		 603 aa  142  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  23.71 
 
 		 603 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  24.44 
 
 		 603 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.4 
 
 		 644 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  23.18 
 
 		 964 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  23.71 
 
 		 603 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  24.7 
 
 		 891 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.03 
 
 		 748 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  23.55 
 
 		 603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  23.55 
 
 		 603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  23.39 
 
 		 603 aa  138  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.95 
 
 		 787 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  23.03 
 
 		 568 aa  137  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.19 
 
 		 986 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  23.04 
 
 		 603 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.22 
 
 		 1093 aa  134  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.1 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  23.2 
 
 		 738 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.87 
 
 		 794 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.49 
 
 		 747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.39 
 
 		 811 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.73 
 
 		 599 aa  126  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  25.18 
 
 		 889 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.63 
 
 		 598 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 987 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  22.78 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  24.03 
 
 		 601 aa  123  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  24.64 
 
 		 961 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.74 
 
 		 1046 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 951 aa  120  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  23.33 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.81 
 
 		 1781 aa  119  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 825 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 1019 aa  118  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  22.19 
 
 		 598 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.67 
 
 		 923 aa  118  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.38 
 
 		 859 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  22.52 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 		 837 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.14 
 
 		 1355 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>