More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4148 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 426 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.46 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.05 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.87 
 
 		 426 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.32 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.21 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 443 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.37 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.37 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.08 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.42 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.97 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.97 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.73 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  20.35 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.8 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.88 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.73 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.56 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.78 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>