More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2612 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  100 
 
 
459 aa  898    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  37.14 
 
 
456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  34.38 
 
 
461 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  32.28 
 
 
453 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  33.03 
 
 
460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.74 
 
 
477 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.02 
 
 
455 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.54 
 
 
456 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.86 
 
 
455 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.86 
 
 
455 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.88 
 
 
447 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.24 
 
 
456 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
447 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
460 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.96 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  33.19 
 
 
447 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
449 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  32.02 
 
 
460 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  32.39 
 
 
460 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.4 
 
 
485 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.39 
 
 
455 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
460 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
454 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.96 
 
 
455 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.85 
 
 
451 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
486 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
454 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
453 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  31.01 
 
 
457 aa  156  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
451 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
454 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
451 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
452 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
454 aa  153  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.2 
 
 
462 aa  153  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
455 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
454 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
460 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
455 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.24 
 
 
478 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
455 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
455 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
455 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.77 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
460 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
459 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
499 aa  146  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
525 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
454 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
518 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
455 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
473 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
456 aa  143  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.5 
 
 
456 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
464 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.17 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
453 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
461 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.2 
 
 
451 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.95 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
452 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.32 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
437 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
458 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
452 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
467 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
452 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.35 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
498 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
454 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
452 aa  137  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
440 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
470 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  26.51 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
453 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  26.51 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.06 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.7 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.73 
 
 
496 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>