More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1607 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  100 
 
 
463 aa  917    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  40.04 
 
 
475 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  35.24 
 
 
464 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
461 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
470 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
475 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
461 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
468 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
445 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
475 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
458 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
453 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
469 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
463 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
462 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.06 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
461 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.23 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25 
 
 
460 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
464 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
464 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.01 
 
 
464 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.01 
 
 
464 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
464 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.79 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
464 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
464 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.47 
 
 
454 aa  126  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
518 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25 
 
 
456 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
462 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
452 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
498 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
481 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
470 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
438 aa  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
453 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.8 
 
 
455 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.65 
 
 
450 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
446 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.5 
 
 
477 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
448 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
500 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
538 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
450 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
483 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.52 
 
 
453 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
468 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
451 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.89 
 
 
546 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.89 
 
 
547 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
495 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.89 
 
 
547 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  26.46 
 
 
480 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  25.41 
 
 
484 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
447 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.89 
 
 
484 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.05 
 
 
502 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
469 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
460 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.57 
 
 
495 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.66 
 
 
546 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
457 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.37 
 
 
463 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25 
 
 
554 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25 
 
 
437 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.68 
 
 
453 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  23.96 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.01 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
447 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
460 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.54 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.63 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  23.34 
 
 
469 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
460 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>