More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1704 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  48.29 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  50.67 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 244 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  36.08 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  36.08 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  36.08 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  46 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 263 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 268 aa  72  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  31.28 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.88 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>