156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1643 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  100 
 
 		 1200 aa  2355    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  31.98 
 
 		 638 aa  137  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  34.24 
 
 		 570 aa  135  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.41 
 
 		 677 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  28.89 
 
 		 641 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.19 
 
 		 501 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  42.86 
 
 		 172 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1161 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.6 
 
 		 458 aa  109  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  33.7 
 
 		 308 aa  108  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  33.2 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  34.14 
 
 		 871 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  37.25 
 
 		 352 aa  99.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25.85 
 
 		 431 aa  97.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25.85 
 
 		 431 aa  97.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  26.71 
 
 		 400 aa  95.5  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.23 
 
 		 423 aa  94.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.21 
 
 		 400 aa  94.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  27.53 
 
 		 422 aa  94.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.7 
 
 		 940 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  25.15 
 
 		 425 aa  93.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.47 
 
 		 416 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.47 
 
 		 416 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.47 
 
 		 400 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.53 
 
 		 899 aa  92.8  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.14 
 
 		 500 aa  92.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.1 
 
 		 416 aa  92  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 423 aa  91.7  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 423 aa  91.7  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  35.29 
 
 		 409 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 		 428 aa  89  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  28.91 
 
 		 341 aa  89  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.24 
 
 		 458 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.8 
 
 		 417 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.66 
 
 		 459 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.33 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.37 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  22.22 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.96 
 
 		 458 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  36.26 
 
 		 302 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  50 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  28.81 
 
 		 452 aa  80.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  23.97 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  28.37 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.53 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.89 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  25.86 
 
 		 454 aa  78.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  23.46 
 
 		 443 aa  78.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  31.93 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  36.78 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.3 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33 
 
 		 2272 aa  75.1  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  24.76 
 
 		 445 aa  74.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  31.63 
 
 		 375 aa  73.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.41 
 
 		 1025 aa  73.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  22.49 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  29.86 
 
 		 707 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.08 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 422 aa  72  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  28.46 
 
 		 635 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 446 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  23.35 
 
 		 439 aa  70.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.42 
 
 		 735 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  25.68 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.3 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  23.79 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  33.33 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  26.85 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  28.93 
 
 		 960 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  27.51 
 
 		 439 aa  68.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2036 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.28 
 
 		 1969 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1001 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.08 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.24 
 
 		 863 aa  66.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.08 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  34.74 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  26.78 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  22.26 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  24.44 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  26.56 
 
 		 564 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  26.47 
 
 		 406 aa  64.3  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  23.97 
 
 		 638 aa  64.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  28.51 
 
 		 831 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.15 
 
 		 467 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.42 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  29.03 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.77 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.23 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  24.48 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  31.16 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.76 
 
 		 1931 aa  62.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.55 
 
 		 447 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.65 
 
 		 510 aa  62  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  32.74 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.15 
 
 		 892 aa  61.6  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.6 
 
 		 467 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  22.73 
 
 		 446 aa  60.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.3 
 
 		 425 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>