More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf284 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf284  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00589486  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  34.23 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  40.29 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2833  tRNA pseudouridine synthase B  39.74 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2321  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  30.04 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  28.97 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  33.33 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  31.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  31.92 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  31.92 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  31.92 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  26.22 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0735  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  28.5 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  26.41 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  32.52 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  36.46 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  35.68 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0927  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000224094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  28.91 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  26.67 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1973  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 		 558 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  29.46 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  26.67 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  26.28 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  25.87 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  26.28 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0361  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.495035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  33.96 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  34.86 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2749  tRNA pseudouridine synthase B  27.05 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  35.1 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  29.25 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  32.14 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  31.6 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0789  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  31.77 
 
 		 412 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3007  tRNA pseudouridine synthase B  25.79 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  26.32 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  29.05 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  36.63 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  26.32 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  36.79 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  26.3 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  26.22 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  27.91 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  32.38 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 351 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  32.14 
 
 		 368 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  27.91 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  26.59 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  31.73 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  31.86 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  32.08 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  29.03 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  32.99 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  27.48 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3165  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.498601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  28.1 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  34.12 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  30.23 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  33.01 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  32.54 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  29.25 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  35.16 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  32.32 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  28.08 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  31.71 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  32.5 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0326  tRNA pseudouridine synthase B, putative  35.5 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  28.3 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  28.77 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3724  tRNA pseudouridine synthase B  27.42 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  35.9 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  29.74 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  28.22 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  34.67 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  28.44 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  32.14 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0063  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>