More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2749 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2749  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 309 aa  613  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3007  tRNA pseudouridine synthase B  69.16 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0761  tRNA pseudouridine synthase B  45.89 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  35.95 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  36.81 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  38.38 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  38.38 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  38.38 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  37.63 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  36.63 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  38.19 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  33.7 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  37.89 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  36.17 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.92 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  35.39 
 
 		 230 aa  149  8e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  37.15 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  35.78 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  35.69 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  29.88 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  33.85 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  34.45 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0361  tRNA pseudouridine synthase B  32.78 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.495035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  35.24 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  33.77 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  36.51 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  34.15 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  35.2 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  33.84 
 
 		 351 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  33.54 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.44 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  34.48 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  33.93 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  34.78 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  34.77 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  36.94 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  33.75 
 
 		 291 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  28.94 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  34.91 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  33.23 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  39.94 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  32.62 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  34.64 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  31.09 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  37.84 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  40.34 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  29.58 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  34.76 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  34.41 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  34.41 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  33.54 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  35.17 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  32.83 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  32.08 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  31.79 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  36.69 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  33.86 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  32.83 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  35.77 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  31.41 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  34.63 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  34.25 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  33.12 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  34.45 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  32.97 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  36.9 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  35.48 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  34.63 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  36.97 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>