More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1807 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 340 aa  684    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  55.33 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  49.4 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  48.37 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  43.67 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  45.87 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  46.08 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  45.62 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  45.41 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  44.34 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  45.25 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  43.29 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  40.75 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  47.42 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  47.42 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  47.42 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  42.99 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  44.78 
 
 		 309 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  40.33 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  45.02 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  41.35 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  46.54 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  39.19 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.26 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  47.84 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  43.81 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  42.47 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  42.21 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  38.51 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  41.55 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  41.89 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  40.5 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  45.87 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  41.52 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  41.16 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.58 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  38.85 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  41.59 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  44.08 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  42.29 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  46.92 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  33.12 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40.18 
 
 		 297 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  40.45 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  40.15 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  39.82 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  39.08 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  46.79 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  36.34 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  39.41 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0761  tRNA pseudouridine synthase B  42.69 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  38.17 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.91 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  41.7 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  41.99 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  41.99 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  38.3 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  33.72 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  42.22 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  41.56 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  44.62 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>