More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0735 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0735  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 285 aa  568  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2321  tRNA pseudouridine synthase B  49.17 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  37.64 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  37.73 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  37.73 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  32.72 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 		 305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  32.79 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 291 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  37.91 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  34.42 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  30.97 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  33.97 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  36.97 
 
 		 304 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  38.97 
 
 		 300 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  32.85 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  36.87 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0361  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.495035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  36.79 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0326  tRNA pseudouridine synthase B, putative  37.74 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3165  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.498601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  33.84 
 
 		 387 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.41 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  33.82 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  40.49 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  36.44 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  37.39 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  39.11 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  32.42 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  30.94 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  38.12 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2818  tRNA pseudouridine synthase B  41.45 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2687  tRNA pseudouridine synthase B  41.45 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  31.4 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  33.64 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1697  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 302 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 302 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 302 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  37.31 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  33.78 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.75 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  40.58 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1673  tRNA pseudouridine synthase B  39.61 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  31.07 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2510  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  34.5 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  30.22 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  36.97 
 
 		 412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  33.57 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  36.06 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  31.35 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>