More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2818 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2818  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2687  tRNA pseudouridine synthase B  98.35 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  47.77 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  46.26 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  46.26 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  47.96 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  44.88 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000961174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  46.42 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  46.8 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 314 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1697  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  45.58 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  43.2 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  45.3 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  40.86 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  45.3 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  43.05 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  43.71 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  46.13 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3387  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  43.89 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  43 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  45.42 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  45.86 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  45.86 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  45.39 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  45.12 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03394  tRNA pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  45.08 
 
 		 298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  45.89 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  44.41 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  43.92 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1093  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0247742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  45.33 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  41.04 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  40.33 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0963  tRNA pseudouridine synthase B  42.11 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0397132  normal  0.0378785 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  42.16 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  45.82 
 
 		 318 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1028  tRNA pseudouridine synthase B  42.19 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1032  tRNA pseudouridine synthase B  42.19 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  hitchhiker  0.0000301922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1009  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0992  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  40.67 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  42.66 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2832  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2825  tRNA pseudouridine synthase B  42.38 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.791691  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  44.67 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  42.95 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  43.24 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  42.63 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0819  tRNA pseudouridine synthase B  41.45 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  42.37 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1130  tRNA pseudouridine synthase B  40.59 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346458  unclonable  0.00000000000626709 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  42.07 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  42.62 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  41.99 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  42.33 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3415  tRNA pseudouridine synthase B  40.26 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630967  hitchhiker  0.000684703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3278  tRNA pseudouridine synthase B  40.26 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.922634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3237  tRNA pseudouridine synthase B  40.26 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  43.24 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  42.28 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  44.52 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>