More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl282 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0326  tRNA pseudouridine synthase B, putative  52.43 
 
 		 292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 		 315 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  39.81 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  43.81 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  39.34 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  40.48 
 
 		 306 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 314 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  36.25 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  40.09 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 314 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  41.59 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  41.12 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  39.9 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  36.29 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  34.49 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0963  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0397132  normal  0.0378785 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 380 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  36.29 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  36.29 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  36.68 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 359 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  33.81 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  36.86 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  42.66 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  36.22 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.4 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 313 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  38.39 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  37.9 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  35.24 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03394  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  37.31 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  39.09 
 
 		 337 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  37.61 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  33.6 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  36.05 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  28.03 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  37.14 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  40.37 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 347 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  31.05 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  39.05 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1093  tRNA pseudouridine synthase B  39.05 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0247742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1032  tRNA pseudouridine synthase B  39.05 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  hitchhiker  0.0000301922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>