More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0326 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0326  tRNA pseudouridine synthase B, putative  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  52.43 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  32.89 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  40.09 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  39.17 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  37.05 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  32.53 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  36.71 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  31.74 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  30.54 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  38.86 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  35.43 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  31.83 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  34.39 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  31.4 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  31.49 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  29.18 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  32.81 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  36.74 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1232  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  36.7 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  36.7 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  37.95 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  31.49 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  37.95 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  37.13 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  26.59 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  30.33 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  30.41 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  35.19 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  32.64 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  32.64 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  23.57 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0735  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  32.28 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  27.65 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  32.99 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  31.49 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  29.82 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  30.07 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  35.51 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2484  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  32.96 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  31.27 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  31.49 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  26.46 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  29.76 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  26.27 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  34.91 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.06 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  31.51 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  29.45 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0676  tRNA pseudouridine synthase B  35.98 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000650493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>